کلیسای بیت لحم که از کلیساهای بزرگ و زیبای شهر اصفهان است در میدان بزرگ جلفا، در منطقه ارمنی ها قرار دارد. این کلیسا در دوره صفویه و پادشاهی شاه عباس کبیر ساخته شده است. گنبد بزرگ این کلیسا در میان کلیسا های اصفهان خود نمایی می کند.
کلیسای بیت لحم توسط شخصی به نام خواجه پطرس ولیجانیان، بازرگان معروف دوره صفوی، بنا شده است. خواجه پطرس و چند تن از اعضای خانواده اش در حیاط کلیسا دفن شده اند. برخی بر این عقیده اند که علت ساخت کلیسای بیت لحم این بود که خواجه پطرس به دلیل ازدحام ورودی کلیسای مریم مقدس و اذیت شدن در آن، تصمیم به ساخت کلیسای جدید گرفت.
روایت دیگر در این زمینه این است که خواجه پطرس که تاجری بزرگ بود در هند جان سپرد. او وصیت کرده بود که جسدش را در جلفا به خاک بسپارند و چنین شد که برای عمل به وصیت وی، این کلیسا در جلفا ساخته شد. تصویر بانی کلیسا بر روی دیوار کلیسا نقش شده است. کلیسای بیت لحم را میتوان هم از نظر نقاشیهای داخلی که بسیار زیبا هستند و هم از نظر نمای خارجی، باشکوه ترین کلیسای اصفهان دانست. بخصوص اینکه دارای بزرگترین گنبد در میان کلیساهای جلفای اصفهان است. گنبد کلیسا دایرهای شکل و بلند، به ارتفاع ۲۵ متر از سطح زمین و به قطر ۱۱ متر است که از نمای بیرونی بسیار ساده به نظر میرسد.
کلیسای بیت لحم در تاریخ ۱۷ اسفند ۱۳۸۱ با شماره ثبت ۷۶۴۳ بهعنوان یکی از آثار تاریخی ایران به ثبت ملی رسیده است.